Elle peut atteindre tout le tube digestif (de la bouche à l'anus), ainsi que la peau, mais se développe le plus souvent sur quelques parties du tube digestif (préférentiellement le côlon, une partie de l'intestin grêle ou de l'anus). C’est une maladie complexe où intervient une composante génétique, le microbiome et des facteurs environnementaux pour certains encore mal compris, qui interagissent entre eux pour produire l'arrière-plan auto-immun de la maladie1 qui évolue par poussées (phases aiguës alternant avec des phases dites de rémission (c'est-à-dire de disparition des signes cliniques de la maladie).